Avec la coopération de ses partenaires trio (les Pays-Bas et la Slovaquie), Malte a participé à la mise en œuvre du programme du Conseil pour identifier les principaux domaines sur lesquels se concentrer pendant la période de 18 mois entre janvier 2016 et juin 2017. À partir de ce programme, chaque membre du trio prépare ensuite un programme détaillé de 6 mois soulignant les questions prioritaires pendant cette période. 

En élaborant le programme trio, les trois Présidences ont été inspirées par les cinq directives prioritaires de l’agenda stratégique adopté par le Conseil européen. L’objectif de ces cinq priorités est que l’UE devienne une union de travail, croissance et compétitivité tout en protégeant et habilitant ses citoyens en confrontant des difficultés telles que la pauvreté et l’exclusion sociale. EIles cherchent également à construire une union avec des politiques climatiques avant-gardistes qui cherchent à défendre liberté, sécurité et justice tout en jouant un rôle de premier plan sur la scène internationale.